主力舰编队的核心在于平衡火力输出与防御能力，同时需要精细考虑指挥值分配和舰船的功能定位。一支舰队最多拥有300到400指挥值来容纳舰船，因此如何在这个限制内搭配出高效阵容是关键。你的战略意图决定了编队方向，无论是正面推进、侧翼包抄还是执行特定战术，都需要围绕明确的卡组概念来构建，让编队有清晰的方向而不是盲目选择角色。舰船在舰队中的前、中、后排位置是由其蓝图中的预设定位决定的，系统会自动分配，敌方会优先攻击前排舰船，因此我们需要通过舰种搭配来保护关键输出单位。
构建主力舰队时，应遵循前中后排的基础逻辑进行舰种搭配。前排必须配置高防御能力的舰船来吸收伤害，例如装甲型护卫舰或战列巡洋舰，它们需要较高的结构值、护甲及抗性。中排通常部署具备持续输出能力或范围增益功能的舰船，例如一些巡洋舰或特定驱逐舰。后排则是部署高爆发伤害或强大控制能力舰船的位置，例如搭载强力鱼雷或离子炮的舰船。阳电子、马尔金、神农、黑鸟等主力舰各具特色，你可以根据战场需求选择一至两种作为舰队核心，再搭配巡洋舰或驱逐舰来填补功能空缺。
编队过程中需要特别注意敌方舰队构成并针对性调整。你需要观察敌方配置，如果敌方舰载机占比较高，就必须在中后排编入足够的防空型战舰或对空战机，例如光锥级配合蜂巢守卫者护航艇。如果敌方以能量武器为主，则红宝石离子炮型护卫舰能起到有效克制作用。面对大型战舰时，卡利斯托级鱼雷舰等对大型舰特化单位是优先选择。舰船武器的战斗序列也至关重要，你可以通过查看敌方主力输出舰船的战斗序列，在前排部署对应类型防御强的舰船，或者让自己舰队中战斗序列克制对手的舰船优先出手。
针对不同的作战目标，主力编队的侧重点也完全不同。进行正面攻坚和阵地战时，需要组建一支能打能抗、以慢速重型舰船为主的正面推进舰队，前排肉盾数量不能太少。而进行机动策应和包夹作战时，则需要编组一支高攻击、移动速度快的输出舰队，其速度甚至比攻击属性更重要，因为包夹舰队可以无视敌方前排直接攻击中后排。在攻城作战时，必须混编诺玛M470、云海级等攻城特化舰船，它们对建筑的破坏效率远高于普通舰船；而在高能辐射区行动时，则只能使用巡洋舰、战列巡洋舰、航空母舰和重型工程舰。
灵活运用游戏机制能让你的主力编队更加高效。你可以使用增援指令，让高人口的主力舰在舰队接敌后增援进场，这能有效突破单支舰队的指挥值限制，但要注意增援舰队会失去曲速航行能力需要提前规划路线。也可以利用高速侦察舰先行抵达目标区域建立计划圈，再让主力舰队曲速过去以节省时间。编队完成后，务必在基地的舰队编组界面中将自己的方案保存为模板，方便日后快速部署和调整，这将大幅提升你的战术响应速度。
